建立質量追蹤體系，是GAP管理的核心，是產品質量管理監控手段。產品質量可追蹤性，是指單個農戶生產者或生產經營者組織的產品，可以從農戶一直追蹤到加工完成的成品，同時也可以從加工完成的成品反追回到它的源頭——生產者。產品質量追蹤實質上是對產品身份的識別，是保證產品質量的重要措施。
建立產品質量追蹤的根本目的，在于明確產品的身份，確定產品質量問題的來源，一旦發現有質量問題的產品，可以追蹤到特定的地區，鄉村或農戶，以便采取有效措施加以糾正，保證該地區產品的繼續使用，為農戶、消費者和社會提供潛在的益處，對穩定產品銷售市場，保證和穩定產品質量都具有重要的意義。通過建立質量追蹤體系，可以最大限度地保證產品生產質量的可靠性、穩定性、可以促進形成一種不斷提高產品質量的新機制。