由于有些養殖戶不注意抗生素添加的數量、方式和方法，產生一些副作用。如果持續作用，易使病原菌產生抗藥性，降低抗疾病效果和養殖經濟效益，而且在特種動物產品中殘留的抗生素會給人體健康帶來危害。如何添加抗生素，現介紹五點方法。
控制添加數量
在使用抗生素時，應按照抗生素的說明要求去使用，不要隨意加量。如土霉素用作治療特種動物疾病時，可在每噸飼料中添加10克～15克，過分添加，不僅增加成本，增強病原菌的耐藥性，而且污染環境，降低效益。
控制用藥時間
如果長期使用同種抗生素，會抑制腸道內某些有益微生物的正常生長和繁殖；要控制用藥時間，有效地限制藥物在畜禽產品中的殘留量。
密切注意配伍禁忌
市場上銷售的抗生素種類多，如果使用時不注意配伍禁忌，不但起不到預防治療作用，還可能引起特種動物中毒死亡。如四環素類與青霉素、磺胺素、氯霉素有配伍禁忌。
分清不同特種動物種類
不同種類特種動物、同種特種動物的不同生長階段及體型大小、生產性能高低，對抗生素要求有區別。
與飼料混合均勻
使用抗生素時應制成預混劑，然后再拌入飼料中，這樣一般較易拌勻。嚴禁將抗生素純品直接拌入飼料，這樣往往會因攪拌不勻，而引起特種動物中毒。