兒童可用的抗生素種類很多，每一種都有不同的針對性和禁用范圍。
紅霉素：治療肺炎、骨髓炎、癤癰、敗血癥及創傷性感染，尤其對抗青霉素的金葡菌引起的敗血癥、肺炎有特效。另外，它還可以治療咽炎、梅素、破傷風、性病、肉芽腫等病。口服的紅霉素兩種。肝病患兒忌用。
麥迪霉素：抗菌效果稍遜于紅霉素，但對紅霉素耐藥菌有效。常用于治療癤癰、扁桃體炎、咽喉炎、支氣管炎、肺炎、牙齦炎、中耳炎、乳腺炎等。服用麥迪霉素偶爾可見消化道反應、皮疹、血清轉氨酶升高，所以肝功能不良的患兒慎用，新生我也應慎用。
乙酰螺旋霉素：抗菌效果優于紅霉素，主要用于治療扁桃體炎、術后感染、膽囊炎和細菌性心內膜炎。服用此藥，少數病人會有惡心、嘔吐等反應，偶爾會有皮疹出現，此時應減量或停藥。肝、腎功能不全者需減量服用。
黃連素：主要用于腸道感染，治療急性細菌性痢疾、腸炎等效果較好。黃連素在腸道中吸收不良，飯前服用效果較佳。
痢特靈：常用于治療腸道感染，如細菌性痢疾、腸炎、傷寒、霍亂等，也可用于治療十二指腸潰瘍。可引起過敏反應，少數人還可能出現過敏性休克。
氟哌酸：對各種細菌均有較強作用，常用于治療尿路感染及腹瀉。兒童慎用。