3. 擴增產物在凝膠中涂布或成片狀條帶彌散

（1）酶量過高。減少酶量；酶的質量差，調換另一來源的酶。

（2）dNTP濃度過高。減少dNTP的濃度。

（3）MgCl₂濃度過高。可適當降低其用量。

（4）模板量過多。質粒DNA的用量應<50ng，而基因組DNA則應<200ng。

（5）引物濃度不夠優化。對引物進行梯度稀釋重復PCR反應。

（6）循環次數過多；增加模板量減少循環次數至30，縮短退火時間及延伸時間，或改用二種溫度的PCR循環。

（7）退火溫度過低。

（8）電泳體系有問題：

    ①凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大；

    ②凝膠沒有凝固好；

    ③瓊脂糖質量差。

（9）若為PCR試劑盒則可能：

    ①由于運輸儲存不當引起試劑盒失效；

    ②試劑盒本身質量有問題，如引物選擇、循環參數等選擇不當。

（10）降解的陳舊模板擴增也易產生涂布。