腸熱癥是傷寒病和副傷寒病的總稱，主要由傷寒桿菌和甲、乙、丙型副傷寒桿菌引起。典型傷寒病的病程較長。細菌到達小腸后，穿過腸粘膜上皮細胞侵入腸壁淋巴組織，經淋巴管至腸系膜淋巴結及其他淋巴組織并在其中繁殖，經胸導管進入血流，引起第一次菌血癥。此時相當病程的第1周，稱前驅期。病人有發熱、全身不適、乏力等。細菌隨血流至骨髓、肝、脾、腎、膽囊、皮膚等并在其中繁殖，被臟器中吞噬細胞吞噬的細菌再次進入血流，引起第二次菌血癥。此期癥狀明顯，相當于病程的第2～3周，病人持續高熱，相對緩脈，肝脾腫大及全身中毒癥狀，部分病例皮膚出現玫瑰疹。存于膽囊中的細菌隨膽汁排至腸道，一部分隨糞便排出體外。部分菌可再次侵入腸壁淋巴組織，出現超敏反應，引起局部壞死和潰瘍，嚴重者發生腸出血和腸穿孔。腎臟中的細菌可隨尿排出。第4周進入恢復期，患者逐漸康復。
典型傷寒的病程約3～4周。病愈后部分患者可自糞便或尿液繼續排菌3周至3個月，稱恢復期帶菌者。約有3%的傷寒患者成為慢性帶菌者。副傷寒病與傷寒病癥狀相似，但一般較輕，病程較短，約1～3周即愈。
傷寒或副傷寒病后有牢固的免疫性，很少再感染。主要依靠細胞免疫，表現為單核巨噬細胞系統在淋巴因子的作用下，胞內酶數量增多，活性增強，從而殺死寄生在細胞內的細菌。