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近年來，許多地方改種對水稻條紋葉枯病抗耐性較好的品種，由此也造成了一些對稻瘟病特別是穗頸瘟抗性較差的水稻品種被大面積應用。為此，專家提醒稻農，水稻抽穗揚花期若遇連陰雨天氣，應警惕穗頸瘟的大發生。
據介紹，稻瘟病在水稻苗期、移栽后的分蘗期和抽穗期侵染，形成苗瘟、葉瘟和穗頸瘟。其中穗頸瘟對水稻影響最大，危害主穗梗至第一枝梗分枝的穗頸部及穗軸、枝梗，使產量和品質下降。
穗頸瘟的發生與品種抗性有很大關系。將對稻瘟病的抗性作為育種目標選育品種，在篩選鑒定時必須考慮到品種對當地稻瘟病生理小種的抗性。自然環境下，種植抗病品種后，一些處于弱勢的稻瘟病生理小種會上升為主要致病因素，使原來抗病的品種變得感病。新品種的抗性一般只能穩定3～5年。
穗頸瘟的發生，主要決定因素還是抽穗揚花期的天氣情況。抽穗期（8月中下旬）陰雨連綿、氣溫低，易流行。近幾年氣候條件不適合病菌侵染，田間幾乎采集不到稻瘟病病株。根據氣候的變化規律推斷，今年水稻抽穗揚花期遇連陰雨天氣較多，再加上田間菌源充足，穗頸瘟易發生，生產上應加以警惕。
防治穗頸瘟方法，一是選用抗病品種；二是合理施肥，增施有機肥、磷鉀肥；三是科學用水，避免深水漫灌，保持田間濕潤，連陰雨天注意清溝排水；四是應用藥劑防治，在破口前2～3天，每畝用40％富士1號乳油75～100毫升或20％三環唑可濕性粉劑100克，加水50～75公斤噴霧，7～10天后根據天氣情況再用藥一次。
