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常見的分析方法中，峰面積定量是首選的。原則上講，峰面積是兩維的數據，比峰高包含有更多的信息，用來定量更加可靠。實驗中不管峰形如何（高斯峰或者非高斯峰），峰面積和樣品量存在線性關系。
峰高是可以用來定量的，但一般情況下，相對于采用峰面積定量采用峰高定量的線性范圍比較窄。
我們在檢索比較傳統的分析文獻時，經常能見到使用峰高定量的場合，尤其是使用TCD或ECD檢測器的分析方法。
主要原因有兩個：
1.TCD是濃度性檢測器，分析環境的不穩定（例如柱流量）對色譜峰高的影響比峰面積為小。
2.色譜記錄條件的限制
傳統的記錄儀或者積分儀得到的譜圖，需要手工測量峰高或者峰面積。測量峰高只需要用到刻度為mm級別的直尺，測量峰面積則另外需要讀數顯微鏡來確定峰寬，另外還需要考慮峰是否對稱、基線是否漂移等諸多因素，顯然峰高的測定比峰面積要容易和準確的多。尤其是保留時間短、峰寬較小的組分，手工測定峰面積是比較困難的。
現在實驗室基本采用色譜數據工作站的方法來測量色譜峰，那么色譜記錄條件的不再成為限制，目前我們看到的分析方法，就比較少采用峰高定量了。
另外：
如果相鄰的兩個或多個色譜峰分離度較低，用峰高定量會更加準確。
如果色譜峰信噪比較低，由于基線位置不容易確定的原因，用峰高定量會更加準確。
如果色譜峰對稱性較差，用峰面積定量更加準確。
