培養(yǎng)條件人為控制：植物克隆中的植物材料完全是在人為條件下生長的，幾乎沒有外界不利因素的影響，且條件均一，有利于植物生長。由于植物克隆不受氣候和季節(jié)的限制，因此，在進行苗木繁殖時便于穩(wěn)定地進行周年生產(chǎn)。

生長周期短繁殖速度快：植物克隆可人為控制培養(yǎng)條件，生長周期短，往往幾天到幾十天可完成一個繁殖周期，每一繁殖周期可繁殖幾倍到幾十倍，甚至上百倍，植物材料能按幾何級數(shù)大量遞增，成本低廉，利于工廠化大生產(chǎn)，尤其在良種苗木及優(yōu)質(zhì)無毒種苗的快速繁殖方面是其他任何方法無可比擬的。

管理方便，利于自動化：植物克隆是在一定的場所環(huán)境下，進行高度集約化的科學生產(chǎn)方式，與盆栽、田間栽培等方法相比除去了中耕除草、澆水、施肥和防治病蟲等一系列繁雜勞動，可以大大節(jié)省人力、物力及田間種植所需要的土地，便于實現(xiàn)流水線作業(yè)，如2—3人，在20—30m2的培養(yǎng)室里1年就可以生產(chǎn)幾十萬株苗。因繁殖材料微型化了，空間的利用提高了幾十倍或幾百倍，每天接種繼代增植，培養(yǎng)容器不斷地周轉(zhuǎn)，如工廠流水線似的生產(chǎn)，所以效率是相當高的。

材料經(jīng)濟節(jié)省種量：由于植物具有全能性，故單個細胞、小塊組織、莖尖或莖段等外植體經(jīng)培養(yǎng)均可獲得再生植株。在生產(chǎn)實踐中以莖尖、根、葉、子葉、下胚軸、花絲、花瓣等材料進行培養(yǎng)時，只需要幾毫米甚至不到1mm大小的材料就可獲得一株苗木；在細胞及原生質(zhì)體培養(yǎng)時，所需材料更少。由于取材少，培養(yǎng)效果好，對于新品種的快速繁殖和良種復壯更新都有很大的應用價值，特別是良種苗木，有的是經(jīng)過幾十年培育出來的，有的是瀕危植物，這些珍稀繁殖往往以單株的形式存在，均面臨保存、利用和開發(fā)繁殖的問題，而單靠常規(guī)無性繁殖方法，需要幾年或幾十年才能繁殖為數(shù)不多的苗木，而用植物克隆方法可在短期內(nèi)生產(chǎn)上百萬株苗木，同時可節(jié)省大量的種子。

培育無毒苗：采用扦插、嫁接、分株及埋條等營養(yǎng)器官繁殖的苗木，都有可能攜帶一種甚至多種病毒或類似病毒，對苗木的生長及產(chǎn)品質(zhì)量和產(chǎn)量都會產(chǎn)生不良影響。在植物克隆中，利用微莖尖培養(yǎng)可脫除植物所帶病毒，獲得無毒苗，以此作繁殖材料，可繁殖大量無毒苗木，以滿足生產(chǎn)需要。果樹無毒苗生長快、抗逆性強、結(jié)果早、果品產(chǎn)量和品質(zhì)均得到大幅度提高。花卉無毒苗，植株生長勢強，花朵變大，色澤鮮艷，抗逆性提高，產(chǎn)花量上升。農(nóng)作物無毒苗，產(chǎn)量和品質(zhì)提高。

可獲得突變體：在植物克隆中，常常無意中獲得突變體、多倍體新品種，這種突變體新品種有更多的優(yōu)越性，具有抗病、抗鹽堿、花朵大、變色、觀賞價值和經(jīng)濟價值更高的新品種（但絕不是變異體），根據(jù)突變體誘變因子變化規(guī)律，把試管苗置于低溫的條件下誘變和篩選抗寒植株，也可以把試管苗，置于鹽分含量高的培養(yǎng)基上篩選耐鹽、耐旱突變體新品種，通過這種試管苗篩選植物突變體的方法在生產(chǎn)中被廣泛應用。