運輸前，秧苗處于活力旺盛的生長階段，在正常生長條件下，光合強度大，呼吸作用也旺盛，一旦離開正常的生長環境(斷絕光、水、肥)，光合作用被阻斷，但呼吸作用仍在進行，溫度每升高10℃，秧苗體內的化學反應速度提高1～2倍。因此，為了減少秧苗的呼吸消耗，應盡量避免溫室高溫時裝箱，防止將田間熱帶入箱內，加大秧苗的呼吸量而降低秧苗的質量。

二、噴秧苗保鮮劑

秧苗保鮮劑具有防病、減少水分蒸發和提高植物免疫等功能，在秧苗運貯前一天按規定的濃度噴施秧苗保鮮劑，保鮮效果顯著。

三、增加箱內濕度

秧苗運輸階段，水分的供給減少，維持較高的空氣濕度可以降低秧苗水分的蒸發強度，從而起到保鮮的效果。但是，濕度過高，特別是高溫高濕有利于微生物活動，導致病害的發生與秧苗的腐爛。因此，運輸時如果溫度適宜或較適宜的溫度偏低，可以通過裝箱前澆水或噴水來增加運輸期間的箱內小環境的空氣濕度；如果外界氣溫很高而運輸工具又無法控溫，可以采用根部微環境的保水處理措施，如在根系水分較好時用保濕材料包裹根系等，以保持秧苗不萎蔫。此外，包裝箱上應有通氣孔，避免秧苗較長時間在濕潤、缺氧條件下呼吸，素質下降。

四、盡量夜間運輸

在炎熱的夏季，晝夜溫差較大，因此在夏季運輸秧苗，要盡可能在夜間行車。另外，夜間運苗，一般路程次日上午即可到達，可爭取時間及時定植，成活率高。